Команда основана в 2008 году и принимает участие в любительских футбольных соревнованиях Дальнего Востока, Амурской области и Благовещенска.
«Благовещенск» включает в себя спортивный коллектив, состоящий из трех команд, принимающих участие в областных и городских соревнованиях («Благовещенск» – основная команда, «Благовещенск В» – ветеранский состав и «Благовещенск М» – молодежный состав).
Неоднократный обладатель Кубка Амурской области и Благовещенска, призер и победитель первенств Амурской области и Благовещенска. Серебряный и бронзовый призёр зоны «Дальний Восток» ЛФЛ. Серебряный призер Кубка Дальнего Востока по футболу-2017. Обладатель Кубка Дальнего Востока по футболу (2018, 2019).